烟草EST数据库构建及cDNA阵列技术建立  

Construction of EST Data Base and Establishment of cDNA Array

作　　者：李文正[1] 宋利民[1] 李永平[1] 卢秀萍[1] 骆红梅[2] 戴承恩[3] 方永启[3] 董海涛[3] 李德葆[3] 

机构地区：[1]云南省烟草科学研究所,云南玉溪653100 [2]杭州师范大学生命与环境科学学院,浙江杭州310036 [3]浙江大学生物技术研究所,云南杭州310029

出　　处：《农业生物技术学报》2008年第4期662-669,共8页Journal of Agricultural Biotechnology

基　　金：云南省烟草公司科技计划项目(No．0515);国家自然科学基金项目(No．30560062)资助。

摘　　要：一组容量为5 927条烟草(Nicotiana tabacum)EST的数据(GenBank登录号为CV015900～CV021826),包含521个重叠群和3 079个独立EST。EST数据分析显示:高丰度表达基因主要涉及光合代谢、蛋白合成等植物基本的生理功能;而低丰度表达基因则占假定独立转录本(TUTs)总数的85.5%。在此基础上,制备完成cDNA阵列,并应用于盐胁迫下烟叶的基因表达谱分析,结果表明,盐胁迫即可使烟草叶片的基因表达谱发生显著改变,并涉及多个重要的植物生理过程。包括水通道蛋白PIP2a、乙烯应答蛋白酶和mRNA剪接因子prp31等42个基因的检出,为阐明植物胁迫反应的调控机制提供新的线索。A Nicotiana tabacum eDNA library consisting of 5 927 high quality sequences was sequenced （GenBank accessiion No. CV01590O-CV021826 ）. By analyzing the EST sequences, the proportion of N.tabacura genes were identified at EST level. A cDNA army was constructed based on the tentative unique transcripts （TUTs） derived from EST assembling results. A total of 42 differentially expressed genes were identified including plasma membrane intrinsie protein 2a, ethylene-responsive proteinase, and Pre-mRNA splicing factor prp31 gene etc., suggesting that there was a complicated biological procession in N.tabacum under saline stress.

关 键 词：烟草 表达序列标签 CDNA阵列 实时定量PCR 

分 类 号：S188[农业科学—农业基础科学]