八肋游仆虫核糖体蛋白L11的基因克隆与序列分析  

Cloning and Sequence Analysis of Ribosomal Protein L11 from Euplotes octocarinatus

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作  者:张志云[1] 王玉瑶[1] 梁爱华[1] 

机构地区:[1]化学生物学与生物工程教育部重点实验室,山西大学生物技术研究所,太原030006

出  处:《四川动物》2008年第5期768-770,共3页Sichuan Journal of Zoology

基  金:国家自然科学基金资助项目30670282;科技部国际合作重点项目2006DFA31960

摘  要:以单细胞真核生物八肋游仆虫Euplotes octocarinatus为实验材料,采用PCR、RT-PCR方法克隆了核糖体蛋白L11基因(EoRPL11)。将该序列与GenBank中其他物种的RPL11基因序列进行同源性比对,采用DNAStar软件进行聚类分析。结果显示,成功克隆到游仆虫RPL11基因,大核中该基因全长709bp,开放阅读框(ORF)为531bp,编码176个氨基酸;cDNA序列与大核中ORF序列一致,表明该基因具有转录活性;所推导的氨基酸序列与嗜热四膜虫Tetrahymena thermophila的RPL11同源性最高,为66%。The gene EoRPL11 encoding the ribosomal protein L11 in Euplotes octocarinatus was amplified by PCR and RT- PCR. The deduced amino acid sequence of EoRPL11 was aligned with other RPL11s from different organisms. Phylogenetic relationship between EoRPL11 and some other RPL11 s was analyzed by DNAStar. The results showed that: the EoRPL11 gene in macronuclear DNA was 709 bp, containing an open reading frame (ORF) of 531 nucleotides which encoded a putative protein of 176 amino acids. Transcriptional activity of EoRPL11 was confirmed by RT-PCR. The deduced amino acid sequence shared 66% identity with RPL11 from Tetrahymena thermophila.

关 键 词:核糖体蛋白L11 克隆 纤毛虫 八肋游仆虫 

分 类 号:Q78[生物学—分子生物学]

 

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