运用染色质免疫沉淀技术筛选出AP-2α的靶基因GALK1  

Screend Target Gene GALK1 of Transcription Factor AP-2 Alpha by Chromatin Immunoprecipitation Assay

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作  者:肖湘文[1] 贺爱兰[1] 周畅[1] 任道龙[1] 胡翔[1] 韩梅[1] 张健[1] 

机构地区:[1]湖南师范大学生命科学学院,蛋白质化学与发育生物学教育部重点实验室,湖南长沙410081

出  处:《激光生物学报》2008年第5期582-586,共5页Acta Laser Biology Sinica

基  金:教育部长江学者和创新团队发展计划项目(IRT0445);国家自然科学基金项目(30500258);湖南省教育厅课题(05C393)

摘  要:在后基因组时代,DNA-蛋白质的相互作用是研究基因表达调控的一个重要领域。与其他方法相比,染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation assay,ChIP)是一种近来研究体内DNA与蛋白质相互作用的最好方法之一。本研究利用ChIP克隆方法,找出了AP-2α所调控的新的下游靶基因GALK1,并应用Lucifer-ase assay和RT-PCR实验进行了初步的验证。这一新发现,有利于我们进一步研究转录因子AP-2α的功能。In the post-genomic era, identifying and characterizing various DNA-protein interactions are a major challenge in the research of gene transcriptional regulation. Nowadays, in comparison with other methods, chromatin immunoprecipitation assay (CHIP) is ideally suited for studying DNA-protein interactions in vivo. In this study, by utilizing the chromatin immunoprecipitation assay, the unknown target gene GALK1 of transcription factor AP-2 alpha has been screened, and we validated the results with Luciferase assay and RT-PCR. With the new discovery, we can study further about the function of the transcription factor AP-2 alpha.

关 键 词:染色质免疫沉淀技术 靶基因 AP-2Α galactokinase(GALK1) 

分 类 号:Q781[生物学—分子生物学]

 

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