根据蛋白质互作网络预测前列腺癌相关蛋白质的细致功能  

Finding finer functions for proteins related to prostate cancer based on protein interaction network

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作  者:李彦辉[1] 马文财[1] 郭政[1,2] 龚雪[1] 张敏[1] 姚晨[1] 王靖[1] 

机构地区:[1]哈尔滨医科大学生物信息学系与生物医药省部共建国家重点实验室培育基地,哈尔滨150086 [2]电子科技大学生命科学与技术学院生物信息学中心,成都610054

出  处:《生物信息学》2008年第4期145-147,共3页Chinese Journal of Bioinformatics

基  金:国家自然科学基金(30370388;30670539)

摘  要:对于功能部分已知的前列腺癌相关蛋白质,提出了一种基于Gene Ontology的功能特异的子网构建方法来细化其功能注释。结果显示该方法能够以很高的精确率为前列腺癌相关蛋白质预测更为精细的功能。预测的相关蛋白质的功能对于指导实验研究前列腺癌的分子机制具有重要的价值。For partially characterized proteins related to prostate cancer, we suggest an approach to find their finer functions based on protein interaction sub- networks defined in function - specific subspaces based on Gene Ontology. The results show that the proposed approach is able to reliably find finer functions for the proteins related to prostate cancer with high precision. The predicted finer functions are highly valuable for guiding the follow- up wet- lab research to study the molecular mechanism of prostate cancer.

关 键 词:前列腺癌 蛋白质功能 蛋白质互作网络 GENE ONTOLOGY 

分 类 号:Q61[生物学—生物物理学]

 

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