丙酮醛诱导细胞凋亡相关基因COX-VA的生物信息学分析  

Bioinformatics Analysis for Cell Apoptosis Induced by Methylglyoxal Related Gene COX-VA

作　　者：曾军英[1,2] 刘学伟[3] 张杰[3] 汤少勋[2] 谭支良[2] 

机构地区：[1]中国科学院研究生院,北京100039 [2]中国科学院亚热带农业生态所,湖南长沙410125 [3]云南大学,云南昆明650091

出　　处：《生物信息学》2008年第4期164-167,共4页Chinese Journal of Bioinformatics

基　　金：国家自然科学基金项目资助(NO:30260027);中国科学院知识创新工程重要方向项目(KSCX-YW-N-051)

摘　　要：在用基因芯片技术检测丙酮醛诱导人牙周膜成纤维细胞凋亡的基因表达研究中,发现一个未知基因表现为显著下调,其名称是COX-VA,并推测该基因与细胞凋亡密切相关。因此利用生物信息学方法对COX-VA基因及其蛋白产物进行各种分析,发现COX-VA基因与细胞色素C氧化酶具有较高的相似性。COX-VA在细胞中低表达与丙酮醛造成线粒体DNA损伤所引发的细胞凋亡相关。Previous studies in ottr lab have shown a down - regulated gene expression （COX- VA） which may be related to apoptosis of humnan periodontal ligament fibroblasts（HPDLFs） , induced by methylglyoxal（MG）. In this study, we used bioinfonnatics analytic methods to further understand the homology, structure of gene and potential functions and location for its ceded protein. The results have shown COX-VA has great homology with mitochondrial cytochrome c oxidase. The down expression of COX- VA could lead to mitochondrial DNA damage including oxidative lesions, resulted in apoptosis of HPDLFs induced by MG.

关 键 词：丙酮醛 基因芯片技术 COX—VA 生物信息学 

分 类 号：Q617[生物学—生物物理学] TP391[自动化与计算机技术—计算机应用技术]