鼠疫菌抗原CTL表位预测方法的建立  

Study on prediction of CTL Epitope for Yersinia pestis antigens

作　　者：王文敬[1] 张艳玲[2] 李明[3] 

机构地区：[1]南方医科大学生物技术学院输血医学系,广州510515 [2]南方医科大学生物技术学院实验中心,广州510515 [3]南方医科大学生物技术学院抗体工程研究所,广州510515

出　　处：《中国地方病学杂志》2008年第6期683-685,共3页Chinese Jouranl of Endemiology

基　　金：国家“973”科技攻关项目（2002CB513201）

摘　　要：目的建立鼠疫菌抗原CTL表位的预测方法，为鼠疫菌表位组学研究提供行之有效的研究平台。方法采用nHLAPred、BIMAS和SYFPEITHI网络预测法对LcrV抗原的CTL表位进行预测。结果预测得到了LcrV的特异性CTL优势表位：V8～16NPQHFIEDL、V311～319KYDSVMQRL和V258～264SYNKDNNEL。结论结合不同预测方法进行T细胞表位的预测，可得到鼠疫菌LcrV抗原的CTL表位，具有较高的准确率，可为表位图谱的绘制提供参考依据。Objective To establish a method predicting CTL epitopes of antigens in Yersinia pestis, which provides an effective research plan for epitornics in Yersinia pestis. Methods CTL epitopes were predicted by nHLAPred, BIMAS and SYFPEITHI. Results CTL epitopes of LcrV antigen were detected as V8-16 NPQHFIEDL, V311-319 KYDSVMQRL and V258-264 SYNKDNNEL. Conclusions Prediction of CTL epitope can be used to make epitope mapping because of its high accuracy. It may provide a reference for the epitope mapping plan.

关 键 词：CTL表位 预测 LcrV 抗原 

分 类 号：R686[医药卫生—骨科学]