PRRSV流行株Nsp2、ORF5和ORF3基因序列的分析  

Nsp2,ORF5 and ORF3 Gene Sequence Analyses of PRRSV Isolate strains

作　　者：王旭荣[1,2,3] 张彩勤[1,3] 赵炳武[1,4] 张春红[1] 杨增岐[3] 宋长绪[1] 

机构地区：[1]广东省农业科学院兽医研究所,广东广州510640 [2]中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,甘肃兰州730050 [3]西北农林科技大学,陕西杨陵712100 [4]北京必威安泰生物有限公司,内蒙古呼和浩特010018

出　　处：《动物医学进展》2008年第12期1-5,共5页Progress In Veterinary Medicine

基　　金：国家食品安全重大专项项目(2001BA804A31);广东省农业科技攻关项目(2003B21404、20052490100和2006B20301013);广东省自然科学基金项目(04002083);广东省自然基金重点项目(06105311)

摘　　要：采用RT-PCR方法扩增2006年--2007年从江西、湖南、海南、广东等4省的不同猪场病猪体内分离的11株猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）流行株的Nsp2、ORF5和ORF3基因，并进行序列分析。结果表明，11个PRRSV流行株的Nsp2均发生30个氨基酸的不连续缺失，缺失位置与JXA1毒株相同；11个PRRSV流行株的ORF5、ORF3基因和JXA1相应序列的核苷酸同源性分别为99．2％～99．8％、99．1％～99．6％，氨基酸同源性分别为98．0％～99．5％、98．4％～99．6％；11个PRRSV流行株之间ORF5基因的核苷酸同源性和氨基酸同源性分别为98．8％～100．0oA、98．0oA～100．0％，其中5个流行株的ORF3基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为99．0％～99．6％、98．8％～99．69，6。根据Nsp2所建立的遗传系统发育树可知这11个PRRSV流行株与JXA1株的亲缘关系很近。11 PRRSV isolates newly were isolated from nosopoietie pigs in Jiangxi, Hunan, Hainan and Guangdong provinces respectively. The sequence analyses of Nsp2, ORF3 and ORF5 showed that these isolates had a discontinuous deletion of 30 amino acids in Nsp2. The ORF5 and ORF3 of 11 PRRSV isolates shared 99.2%-99.8% and 99.1%-99.6% nucleotide homologies, and 98.0%-99.5%, 98.4%-99.6% ami- no acid homologies with that of JXA1, respectively. The ORF5 of 11 PRRSV isolates shared 99. 0%- 100.0% ,nucleotide homologies and 98.0%-100.0% amino acid homologies with each other. The ORF3 of 5 PRRSV isolates shared 99.0%-99.6% nucleotide homologies and 98.8%-99.6% amino acid homologies with each other. The phylogenetic tree suggested that the isolates from different provinces had close relationship, which were evolved by same strain.

关 键 词：猪繁殖与呼吸综合征病毒 NSP2 ORF5 ORF3 序列分析 

分 类 号：S852.659.6[农业科学—基础兽医学] Q781[农业科学—兽医学]