一种新型氨基酸拓扑结构信息矢量及在肽定量构效关系研究中的应用  

作　　者：李志良[1,2] 李根容[1,2] 舒茂[1,2] 孙家英[1,2] 杨善彬[1,3] 梅虎[1,4] 张梦军[1,2,3] 周萍[1,2] 吴世容[1,2] 陈国华[1,2] 吕凤林[1,3] 吕廷亭[1,2,3] 

机构地区：[1]重庆大学化学化工学院,生物工程学院,重庆400044 [2]化学生物传感与计量学国家重点实验室,长沙410012 [3]第三军医大学医学检验系,重庆400037 [4]新加坡国立技术学院生命科学技术中心,新加坡139651

出　　处：《中国科学（B辑）》2008年第8期745-754,共10页Science in China(Series B)

基　　金：国家“863”项目(2006AA02Z123);霍英东基金(98-7-6);国家新药基金(97-8-6);化学生物传感与计量学国家重点实验室基金(2005012);重庆直辖市应用基础基金(01-3-6);重大自主创新基金科技攻关项目(04-9-9)资助

摘　　要：从表征分子的66个结构参量和拓扑指数出发,经主成分分析(PCA)得到一种包含134个氨基酸体系的特征描述子:氨基酸拓扑与结构信息矢量(VTSA).将其应用于58个血管紧张素转化酶抑制剂(ACEI)和88个弹性蛋白酶模拟底物催化动力体系(ESCK)的定量构效关系(QSAR)或定量序效模拟(QSAM)研究中,结合遗传偏最小二乘(GPLS)、支持向量机回归(SVMR)以及本文设计的免疫神经网络(INN)技术,成功建立了上述两个肽类似物样本集定量预测模型,并取得优于已有文献报道的结果:ACEI,Rcu2≥0.82,Rcu2≥0.77,Ermse≤0.44(GPLS+SVM);ESCK,Rcu2≥0.84,Rcu2≥0.82,Ermse≤0.20(GPLS+INN).

关 键 词：氨基酸拓扑结构信息矢量(VTSA) 定量构效关系(QSAR) 定量序效模拟(QSAM) 分子结构与拓扑特征描述子(MSCD) 血管紧张素转化酶抑制剂(ACEI) 弹性蛋白酶模拟底物催化动力体系(ESCK) 

分 类 号：O629.7[理学—有机化学]