膜蛋白质间原子填充结构预测方法研究  

Research on Prediction Methods of Membrane Protein Atomil Inter Filled Structure

作　　者：刘海龙[1] 孙鹏飞[1,2] 伦立军[1] 李振兴[1] 

机构地区：[1]哈尔滨师范大学计算机科学与信息工程学院,黑龙江哈尔滨150040 [2]哈尔滨工程大学计算机科学与技术学院,黑龙江哈尔滨150001

出　　处：《哈尔滨理工大学学报》2008年第6期13-15,共3页Journal of Harbin University of Science and Technology

基　　金：黑龙江省教育厅科学技术研究项目(11511118);哈尔滨师范大学科学技术研究项目(KM2006-06)

摘　　要：根据蛋白质间三对三原子填充结构定义,对膜蛋白质间的原子填充结构进行解析,利用不同类型氨基酸形成填充结构的频率,构建了三对三原子填充结构的可能性矩阵,并研究了使用该矩阵进行填充结构预测的方法.In this paper, the analysis of contacts in membrane proteins have been brought forward on the basis of the definition of 3to3 contact. Using frequencies of different amino acids in 3to3 contacts the likelihood matrix of 3to3 contact was established, and the prediction method of 3to3 contact based on the likelihood matrix was discussed.

关 键 词：膜蛋白质 填充结构 可能性矩阵 预测 

分 类 号：TP39[自动化与计算机技术—计算机应用技术]