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作 者:刘雅婷[1,2] 卢秀萍[3] 郑元仙[1] 李永忠[2] 李正跃[4]
机构地区:[1]云南农业大学农学与生物技术学院,昆明黑龙潭650201 [2]云南农业大学烟草学院,昆明650201 [3]云南省烟草科学研究所,玉溪653100 [4]云南农业大学植保学院,昆明650201
出 处:《中国烟草学报》2008年第6期53-56,共4页Acta Tabacaria Sinica
基 金:云南省自然基金项目(No.2005C0036M和2007C0036M);云南省教育厅自然基金项目(No.5Y0171B);国家973项目(2006CB100204)
摘 要:2004-2007年间对云南省烤烟种植区进行调查,在云南省楚雄和文山2个地区,获得3份疑似Tospovirus属病毒的样本。通过Tospovirus组引物(Tospovirus Group Primer)进行RT-PCR扩增、克隆和测序,获得500nts核酸片段,通过NCBI BLAST网络数据库比对,确定这3份样品为Tospovirus属的病毒;通过DNAman软件比对分析所得到的核酸序列和已经公布的Tospovirus属病毒RNA L同位点序列,从得到的系统进化图可以看出,云南3个样品明显分为2簇,即YN-1和YN-2,分别与血清组I和Ⅵ的Tospovirus属病毒聚为一簇。Three samples from the genus Tospovirus were collected from major tobacco fields of Chuxiong and Wenshan in Yuannan from 2004-2007 survey. After RT-PCR, clone, sequencing using Tospovirus Group Primers and comparison with results from NCBI Blast, the 3 samples were confirmed to be from Tospovirus genus because of containing the Tospovirus RNA L fragments. A phylogenetic tree based on the sequence of three sample virus and their corresponding public RNA L fragment sequences of Tospovirus was constructed using DNAman software. The phylogenetic tree indicated that 3 Yuannan samples were grouped into two clusters: YN-1 and YN-2, which fell into the same cluster as the Serogroup I, and Ⅵ, respectively.
分 类 号:S435.72[农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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