系统发育谱构建方法研究  

Research on Construction of Phylogenetic Profile Methods

作　　者：黄萍[1] 孙平平[1] 马雅楠[1] 张爽[1] 藏露[1] 欧阳玉梅[1] 马志强[1,2] 

机构地区：[1]东北师范大学计算机学院,长春130117 [2]吉林大学计算机学院,长春130000

出　　处：《生物信息学》2009年第1期78-80,共3页Chinese Journal of Bioinformatics

基　　金：教育部应用统计重点实验室资助

摘　　要：随着后基因组时代的到来,系统发育谱方法作为一种非同源性的功能注释方法,已经被成功的应用到基因组功能预测、蛋白质相互作用预测等一些重要领域的研究中去。本文阐述了系统发育谱法的基本原理,详细地介绍了现有的几种系统发育谱的构建方法,并提出了利用ortholog来构建基因的系统发育谱的思想。With the advent of the post- genomic era, as one of the non- homology based functional annotation approach, phylogenetic profile method has been sueeessfttlly applied in the research of some important fields, such as genome functional prediction and protein - protein interaction prediction. This paper describes the principle of phylogenetic profile method, expatiates several phylogenetic profile construction approaches, and proposes a ortholog based method for the construction of phylogenetie profile.

关 键 词：系统发育谱 基因功能注释 ORTHOLOG 

分 类 号：Q753[生物学—分子生物学]