烟草品种Xanthi NN碱性β-1,3-葡聚糖酶基因的克隆与生物信息学分析  

作　　者：王转梅[1] 陈崇顺[1] 王轶[1] 曹伟杰[1] 邹爱兰[1] 马文晔[1] 张娟[1] 

机构地区：[1]南京师范大学生命科学学院/江苏省生物多样性与生物技术重点实验室,江苏南京210046

出　　处：《江苏农业科学》2009年第1期28-30,31,共4页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：国家自然科学基金(编号:30371010)

摘　　要：烟草碱性β-1,3-葡聚糖酶具有较强的抗真菌病害等作用。本研究根据烟草Samsun与抗真菌作用有关的碱性β-1,3-葡聚糖酶基因序列设计引物,以烟草(Nicotiana tabacum)品种Xanthi NN基因组DNA为模板,进行PCR扩增,后将扩增产物与pUC57-T载体重组,再以该重组体转化大肠杆菌DH5α,在对阳性克隆进行鉴定后测序,并对其编码酶蛋白进行了一级、二级、三级结构及蛋白质同源性比较等生物信息学分析。研究结果表明,该基因全长1 868 bp,包含2个外显子和1个内含子;除终止密码子外,共编码359个氨基酸(GenBank登录号:EU867448)。该酶分子量为28.4 kDa,pI为9.72,是一个碱性蛋白;具有多个螺旋、转角、延伸链和无规卷曲等二级结构,其中α-螺旋占35.65%,β-转角占5.57%,延伸链占19.22%,无规卷曲占39.55%;三级结构同源建模预测显示,它与香蕉(Musa supientum)β-1,3-葡聚糖酶(PDB number 2cygA)具有60%的一致性;推测该酶蛋白与颠茄(Atropa belladonna)、马铃薯(Solanum tuberosum)等茄科植物的β-1,3-葡聚糖酶编码序列同源性分别达到89%和81%。本研究结果为进一步开展烟草抗真菌的β-1,3-葡聚糖酶的基因工程研究奠定了重要基础。

关 键 词：烟草 基因组 碱性β—1 3-葡聚糖酶基因 克隆 生物信息学 

分 类 号：S572.03[农业科学—烟草工业]