广州地区散发性戊型肝炎病毒基因片段序列分析  被引量:6

Nucleic acid sequence analysis of the sporadic hepatitis E virus strains in Guangzhou

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作  者:魏绍静[1,2] PeterWalsh 唐漾波[1,2] 董惠卿 蔡晓莉[1,2] 

机构地区:[1]广州市传染病医院肝炎研究所 [2]香港理工大学医疗系

出  处:《中华微生物学和免疫学杂志》1998年第2期92-95,共4页Chinese Journal of Microbiology and Immunology

基  金:香港1995年CHROUCH基金;广州市科技基金

摘  要:目的对广州地区散发性戊型肝炎病毒(HEV)作基因片段序列分析。方法用逆转录套式聚合酶链反应(RT-nestedPCR)检测了8例广州地区散发性戊肝患者粪便和血清中的HEVRNA,其中3例粪便阳性。对阳性PCR产物进行基因克隆、核酸序列分析。结果广州地区G1、G2、G3株与缅甸株(B)、巴基斯坦株(P)、墨西哥株(M)、中国新疆株(Ch1.1)和广州血清株(G-9)的核苷酸和氨基酸的同源性均值分别为80.67%和88.60%(B)、81.25%和89.20%(P)、77.45%和84.81%(M)、81.25%和89.20%(C)、97.85%和96.20%(G)。结论广州HEV株有一定程度的变异。There were sporadic cases of hepatitis E in Guangzhou.In order to analyze the nucleotide sequence of sporadic HEV strain in Guangzhou, RTnested PCR was used to determine HEV RNA in stool and serum samples of 8 patients with hepatitis E.Three stool samples were positive for HEV RNA. The hemology of nucleic acid and amino acid sequences of 3 HEV strains in Guangzhou compared with the Burmese,Pakistani,Mexican,Chinese Ch1.1 and G9 strains were 80.67% and 88.60%(B),81.25% and 89.20%(P),77.45% and 84.81%(M),81.25% and 89.20%(C),97.85% and 96.20%(G),respectively.The results suggest that HEV strains in Guangzhou have genomutation in some extent.

关 键 词:戊型肝炎病毒 序列分析 基因 聚合酶链反应 

分 类 号:R373.21[医药卫生—病原生物学]

 

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