建立在芯片与生物信息学预测基础上的miRNA靶基因鉴定研究进展  

作　　者：张海峰[1] 吴炳礼[1] 方国强[1] 杜则澎[2] 黄俏[1] 许丽艳[2] 李恩民[1] 

机构地区：[1]汕头大学医学院生物化学与分子生物学教研室,广东汕头515041 [2]汕头大学医学院肿瘤病理研究室,广东汕头515041

出　　处：《癌变．畸变．突变》2009年第2期153-155,共3页Carcinogenesis,Teratogenesis & Mutagenesis

基　　金：国家自然科学基金资助项目(30570829;30672376)

摘　　要：microRNA(miRNA)是一类长度约22个核苷酸(nt)的非编码单链小RNA分子。近年来,大量的研究证明,miRNA参与了许多重要的生物学过程,其异常表达在肿瘤的发生发展中扮演着癌基因或抑癌基因的角色。关于与肿瘤相关miRNA的实验研究方案通常包括4个步骤:①通过基因芯片技术对癌组织与配对的正常组织中差异表达的miRNA进行筛查,确定候选miRNA;②通过生物信息学软件对所获差异表达的miRNA进行靶基因预测,为后续鉴定差异表达miRNA的靶基因提供线索;③通过RISC免疫共沉淀、稳定同位素标记蛋白质谱或miRNA-mRNA复合物分析等实验方法对miRNA的靶基因进行实验室鉴定;④分析差异表达的miRNA及其靶基因与病理、肿瘤复发转移情况以及生存期等临床指标之间的相关关系,确定miRNA的肿瘤生物学意义。在本文中,结合我们实验室最近利用基因芯片技术研究食管癌中差异表达miRNA及其靶基因的实验结果,综述了目前miRNA及其靶基因鉴定方面的最新研究进展。

关 键 词：MIRNA 肿瘤 生物信息学 

分 类 号：Q752[生物学—分子生物学]