基于Cenix运算法则的高效siRNA设计  

The efficient siRNA design algorithms——cenix algorithms

作　　者：逯雯雯[1] 姜江[2] 李玮[1] 

机构地区：[1]山东大学控制科学与工程学院,生物医学工程专业济南250061 [2]东南大学生物科学与医学工程学院

出　　处：《医学检验与临床》2007年第4期5-7,共3页Medical Laboratory Science and Clinics

基　　金：山东大学科技创新基金资助

摘　　要：目前,Cenix算法就是一种siRNA设计运算法则,本文通过对Cenix算法的改进,可以设计出产生更高的有效siR-NAs的比例。从基因库中提取一段基因,并确定其mRNA序列。在传统的Cenix导法中加入遗传算法设计出siRNA并设立阴性对照。最后设计出两条最准确最高效的siRNA和分别的阴性对照组,并与常规的siRNA设计法则设计出的siRNA进行对比,证明确实可以设计出更高效的siRNA。Objective Currently,Cenix algorithm is a siRNA design algorithms.Based on improved Cenix algorithm,it can work out a higher proportion of effective siRNAs.Extraction a Gene section from gene bank,and determine its mRNA sequence.In the traditional cenixalgorithm added to Genetic algorithm design SiRNA and the establishment of the negative control.Finally designed two most accurate and efficiment siRNA were the hegatire control group,and corventional siRNA design rules designed siRNA compared proved to design more efficient siRNA.

关 键 词：RNA干扰 SIRNA MRNA 

分 类 号：Q78[生物学—分子生物学]