PRRSV CH-1a株致弱过程中不同代次病毒结构蛋白基因遗传变异分析  

Genetic variation in the structure protein gene of PRRSV CH-1a strain due to virulence attenuation

作　　者：刘永刚[1] 蔡雪辉[1] 石文达[1] 马平[1] 王淑杰[1] 李成君[1] 武佳斌[1] 徐敏[1] 

机构地区：[1]中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室,黑龙江哈尔滨150001

出　　处：《中国预防兽医学报》2009年第5期346-351,387,共7页Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine

基　　金：十一五国家支撑计划(2006BAD06A07);中国农业科学院院所长基金

摘　　要：对猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)CH-1a株致弱过程中不同代次病毒(S39、S70、S148、S171)及国内分离株(GD3、JS1、JS5)的结构蛋白基因(ORF2～ORF7)进行了克隆和测序,并与国内外毒株序列进行比较和系统发育进化分析。结果表明,PRRSV CH-1a株各传代毒株和国内分离毒株各个结构蛋白序列均存在不同程度的变异,与GenBank上的登录序列进行了比对,发现GP2～GP5同源性在83.1%～100%,M蛋白同源性在95.4%～100%,N蛋白同源性在87%～100%,其中以GP2、GP3和GP5发生突变几率较大;另外,发现PRRSV CH-1a不同代次病毒GP5的H38突变为Q38(S70),L146突变为Q146(S148),而2006年分离的PRRSV变异毒株由F39突变为I39,而且分离毒株的毒力明显强于经典毒株。进化分析表明,GD3毒株与2006年～2007年分离的毒株以及PRRSV CH-1a株的亲缘关系均较近,处于二者的中间位置。The structure protein genes （ORF2 to ORF7） of PRRSV CH-Ia at 39^th （S39）, 70^th （S70）, 148^th （S148）, 171^th （S171） passages and other PRRSV isolates （GD3, JS1 and JS5） were cloned, sequenced and compared with those of the reference strains published in GenBank. The results showed that the CH-1a strain sustained various sequence changes during the course of attenuation passaging. The amino acid showed 83.1 % to 100 % homology in GP2 to GP5 proteins; 95.4 % to 100 % for M protein and 87 % to 100 % for N protein respectively. Mutations were mainly found in GP5 from H38 to Q38 at $70 passage, L^146 to Q146 at S148 passage of CH-1a strain, and F39 to 139 in GP5 of PRRSV GD3, JS1 and JS5 isolates. The GD3 strain fitted between the isolates in 2006 to 2007 and PRRSV CH-la strain in genetic tree analysis.

关 键 词：PRRSV CH-1A株 致弱 编码结构蛋白 遗传变异 

分 类 号：S852.659[农业科学—基础兽医学]