乙型脑炎病毒E蛋白HLA—A*0201限制性细胞毒性T细胞表位的预测  

Prediction of the HLA2-restricted CTL epitopes derived from the Japanese encephalitis virus envelope protein

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作  者:曲萍[1] 张秀敏[2] 刘利兵[1] 陈健康[1] 刘芳娥[1] 黄小军[1] 

机构地区:[1]第四军医大学基础部教学实验中心,陕西西安710032 [2]第四军医大学基础部病理学教研室,陕西西安710032

出  处:《现代肿瘤医学》2009年第6期1046-1048,共3页Journal of Modern Oncology

基  金:国家自然科学基金资助项目(30400167);陕西省科技计划项目[2007K09-05(2)]

摘  要:目的:预测乙型脑炎病毒E蛋白(Japanese encephalitis virus envelope protein,JEVE蛋白)的HLAA2限制性CTL表位。方法:采用SYFPEITHI超基序法、量化基序多项式方案分析及延展基序方案联合应用,筛选JEVE蛋白HLA-A2限制性的九肽细胞毒性T淋巴细胞(cytotoxic lymphocyte,CTL)表位。结果:通过预测获得了9个JEVE蛋白HLA-A0201限制性的九肽CTL表位。结论:超基序法与量化基序多项式方案分析及延展基序方案的联合应用所产生的JEVE蛋白CTL表位,为进一步研制新型乙脑肽疫苗奠定了重要的基础。Objective :To predict the HLA - A * 0201 restricted CTL epitopes of Japanese encephalitis virus envelope (JEV E) protein. Methods: HLA - A * 0201 restricted CTL epitopes of JEV E protein was predicted by the combined application of SYFPEITHI supermotif prediction, quantitative motif and extended motifs. Results: Nine HLA - A * 0201 restricted CTL epitope candidates derived from JEV E protein were selected. Conclusion: The JEV E protein CTL epitopes generated by the combined application of SYFPE1THI supermotif prediction, quantitative motif and extended motifs laid an important foundation to further develop the new type of JEV peptide vaccine.

关 键 词:日本脑炎病毒E蛋白 细胞毒性T淋巴细胞表位 预测 

分 类 号:R392.11[医药卫生—免疫学] R394.2[医药卫生—基础医学]

 

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