甲型H1N1流感病毒HA蛋白结构模建与构象表位分析  

Structure modeling and spatial epitope analysis for HA protein of the novel H1N1 influenza virus

作　　者：流感研究上海协作组 吴迪 徐天磊 孙静 戴建新 丁国徽 何云刚 周正峰 熊慧 董辉 金维荣 边超 金力 王红艳 王小宁 杨忠 钟扬 王皓 车小燕 黄忠 蓝柯 孙兵 吴凡 袁政安 张曦 周晓农 周佳海 马志永 童光志 郭亚军 赵国屏 李亦学 曹志伟 

机构地区：[1]流感研究上海协作组,上海200092

出　　处：《科学通报》2009年第12期1642-1644,共3页Chinese Science Bulletin

基　　金：国家重点基础研究发展计划(编号:2004CB720103,2006AA02312);上海市教育基金(批准号:2000236018,2000236016)资助项目

摘　　要：最近几个月来,一种新型流感病毒H1N1在全球流行.本文运用生物信息技术,从NCBI发布的新型AH1N1流感病毒基因序列出发,通过同源模建方法构建了HA蛋白三维结构,利用自主开发的蛋白抗原空间表位预测程序SEPPA预测了HA蛋白潜在空间表位氨基酸,并与以往流感病毒HA蛋白潜在构象表位进行了比较.结果发现HA蛋白中58个氨基酸残基具有较强的免疫原性,大部分在HA蛋白球状头部表面上聚集成簇,构成空间抗原表位.与以往流感病毒HA蛋白潜在空间表位相比,虽然坐落位置相似,但新的抗原表位在静电势性质上明显不同于以往流感病毒HA蛋白抗原表位.

关 键 词：甲型H1N1流感病毒HA蛋白 空间表位 生物信息学 

分 类 号：R373[医药卫生—病原生物学]