ε分子内完整的侧向突出结构对鸭乙肝病毒反转录酶启动引发至关重要  

An Undamaged Bulge in ε is Essential for Initiating Priming of DHBV Reverse Transcriptase

作　　者：胡康洪[1,2] 冯辉[1] 李卉[1] 

机构地区：[1]中国科学院武汉病毒研究所病毒学国家重点实验室,武汉430071 [2]德国雷根斯堡大学分子和细胞解剖学研究所,雷根斯堡d93053

出　　处：《病毒学报》2009年第4期296-302,共7页Chinese Journal of Virology

基　　金：国家自然科学基金(No.30870131);中国科学院前沿领域项目(No.0802021SA1)

摘　　要：通过构建鸭乙肝病毒ε(Dε)的RNA文库并利用指数级富集的配体系统进化技术(SELEX)筛选的策略,获得与反转录酶(P蛋白)高度亲和的适配子(Aptamer),再通过体外引发实验和核酸酶切割方法测定全部适配子的RNA二级结构,以研究鸭乙型肝炎病毒(Duck Hepatitis B Virus,DHBV)中对启动P蛋白引发步骤至关重要的ε结构信息。本研究发现凡是支持P蛋白启动引发的高亲和力适配子中均包含完整的侧向突出结构;而一旦侧向突出被破坏,则适配子均不再支持P蛋白启动引发。本研究的结果表明Dε分子内部的一个完整侧向突出结构对于P蛋白启动引发是必不可少的。Previously, we have established an ε library and selected out a series of RNA aptamers with higher affinity to P protein based on the in vitro Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment （SELEX） in duck hepatitis B virus （DHBV） system. In order to study the structural elements within the ε that is essential for initiating priming of HBV reverse transcriptase （P protein）, all selected aptamers were subjected to in vitro priming assay and RNA secondary structure probing. We found that all those aptamers supporting priming had an undamaged bulge, while those lacking of the bulge no more support priming. Our results suggest an undamaged bulge within De is indispensable for initiating priming of P protein.

关 键 词：鸭乙型肝炎病毒 反转录酶 ε 侧向突出 

分 类 号：R373.2[医药卫生—病原生物学]