基于COI序列快速鉴定花蓟马的DNA条形码芯片初探  被引量:13

Molecular Identification of Frankliniella Based on COI Sequences by DNA Barcoding Chip

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作  者:冯毅[1] 王莉[1] 白云峰[1] 王洁[1] 冯纪年[1] 

机构地区:[1]西北农林科技大学植保资源与病虫害防治教育部重点实验室,杨凌712100

出  处:《生物技术通报》2009年第8期169-173,共5页Biotechnology Bulletin

基  金:国家自然科学基金(30570205);国家大学生创新性实验计划资助项目(01082501)

摘  要:利用DNA条形码信息研制DNA芯片,建立快速高效的花蓟马鉴定方法。以3种花蓟马属,共9个样本的COI基因片段序列为研究材料,应用软件Primer Premier5搜索出9个样本的12种motif基因序列,应用这12种motif序列制作虚拟DNA条形码芯片。虚拟电子杂交20个样本的COI基因片段序列。结果显示,设计的虚拟DNA芯片能够鉴定本研究中的3种花蓟马,利用DNACOI基因片段,设计DNA芯片在理论上可行。A quick method of Frankliniella identification by DNA chip that based on the DNA barcoding information was established. Nine COI gene partial sequences of three species of Frankliniella were obtained. Twelve Motif sequences of the nine samples were searched by the software Primer PremierS. Simulated DNAchip were made acorrding to the twelve Motif sequences. CO I gene partial sequences of twenty samples were hybridized with the Simulated DNA chip. It was showed that DNA barcode chip can identify the there spicies of Frankliniella. Integrating the DNA barcode and DNA chip is feasible in theory.

关 键 词:COI基因 DNA务形码 DNA芯片 花蓟马 

分 类 号:S433[农业科学—农业昆虫与害虫防治]

 

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