佳米驴β防御素aBD-1基因克隆及序列分析  

Cloning and Sequence Analysis of Jiami Ass β-defensin aBD-1 Gene

作　　者：屈雷[1] 闫海龙[1,2] 庞全海[2] 敬晓棋[1] 杨银凤[3] 高晔[1] 

机构地区：[1]榆林学院生命科学研究中心,陕西榆林719000 [2]山西农业大学动物科技学院,山西太谷030801 [3]内蒙古农业大学动物胚胎与发育生物学研究室,内蒙古呼和浩特010018

出　　处：《动物医学进展》2009年第8期34-38,共5页Progress In Veterinary Medicine

基　　金：陕西省自然科学基础研究计划项目(2007C112);山西省科技攻关项目(021044);山西农业大学博士启动基金项目(412528)

摘　　要：为获得佳米驴β防御素-1(aBD-1)的全长cDNA序列,为开发其药用功能积累资料。从佳米驴舌黏膜上皮组织中提取总RNA,采用RT-PCR技术扩增出aBD-1(ass-βdefensin-1)cDNA的中间片段后,再采用RACE法,扩增佳米驴β防御素aBD-1的cDNA全序列。aBD-1 cDNA全序列长为360 bp,其中包含192 bp的开放阅读框,37 bp的5′非翻译区(5′UTR),102 bp的3′非翻译区(3′UTR)以及poly(A)26。在GenBank上注册号为EU265778,测序结果和序列生物信息学分析结果表明,其与马β防御素eBD-1、牛的β防御素TAP、绵羊的β防御素sBD-1、猪的β防御素pBD-1和人的β防御素hBD-2的同源性分别为92%、68%、75%、75%和68%。aBD-1全长cDNA是β防御素家族中的一个新基因。To obtain the full-length cDNA sequence of Jiami ass β-defensin-1（aBD-1） and develop its medicine potentiality. Total RNA was extracted from tongue epithelia of a Jiami ass and was reverse transcribed to synthesize the middle fragment of Jiami ass β-defensin （aBD-1） cDNA. Sequentially, the full-length cDNA of Jiami ass β-defensin （aBD-1） were synthesized using RACE. The full-length aBD-1 cDNA is 360 bp and includes a ORF of 192 bp, an 5＇untranslated region （5＇UTR） of 37 bp, an 3＇UTR of 102 bp and ploy （A）26. The GenBank accession number is EU265778, the sequence analysis result shows that it has 92%, 68%,75%, 75% and 68% identity with eBD-1, TAP, sBD-1, pBD-1 and HBD2, respectively. The fulllength eDNA sequence of ass β-defensin-1（aBD-1） is a new gene in the family of β-defensin.

关 键 词：佳米驴 Β防御素 逆转录-聚合酶链式反应 RACE CDNA 

分 类 号：S853.7[农业科学—临床兽医学] S858.39[农业科学—兽医学]