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机构地区:[1]中国科学院生态环境研究中心城市与区域生态国家重点实验室,北京100085 [2]中国科学院研究生院,北京100039
出 处:《生态学报》2009年第8期4455-4463,共9页Acta Ecologica Sinica
基 金:国家自然科学基金资助项目(40571082);国家重点基础研究发展规划资助项目(2005CB121105)
摘 要:硫是水稻必需的营养元素之一。硫酸盐还原是硫元素生物地球化学循环中的关键步骤,在稻田土壤表层和水稻根际都十分活跃。介导硫酸盐还原过程的硫酸盐还原菌(sulfate-reducing bacteria,SRB)是稻田土壤中重要的功能菌群。它们不仅是硫元素生物地球化学循环的重要参与者,也是土壤中有机污染物降解的主要力量之一,发挥着重要的生态和环境功能。综述了稻田土壤中微生物参与的硫酸盐还原过程、SRB的生物多样性以及目前研究稻田土壤SRB主要采用的分子生态学方法,如末端限制性片段长度多样性(T-RFLP)、变性梯度凝胶电泳(DGGE)、实时荧光定量PCR(real-time PCR)、荧光原位杂交(FISH),并对水稻土壤中SRB的分子生态学研究方向进行了展望。Sulfur is one of the most necessary nutrients for rice growth.Sulfate reduction is a key process in the sulfur biogeochemical cycle,which is active in the surface and rhizosphere of the rice paddy soils.Sulfate-reducing bacteria(SRB) are the main functional microbial group and can also play important roles in the degradation of some organic pollutants in the rice paddy soils.This review paper summarized recent major advances in the processes of sulfate reduction and the diversity of SRB in the rice paddy soils.It also introduced some prevalent molecular methods in the studies of SRB in the rice paddy soils,such as terminal restriction fragment length polymorphism(T-RFLP),denature gradient gel electrophoresis(DGGE),real-time PCR,and fluorescence in situ hybridization(FISH).Future perspectives in the molecular ecology of SRB studies were proposed.
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