分子系统发育树构建的简易方法  被引量:6

A simple method to construct the phylogenetic tree

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作  者:田鹏[1] 刘占林[1] 

机构地区:[1]西部资源生物与现代生物技术教育部重点实验室西北大学生命科学学院,西安710069

出  处:《生物信息学》2009年第3期232-233,共2页Chinese Journal of Bioinformatics

基  金:国家自然科学基金项目(30671719);陕西省自然科学基础研究计划(2006C115);教育部留学回国人员科研启动基金([2005]383号);陕西省教育厅专项科研计划项目(05JK297)

摘  要:以系统发育树构建的原有距离方法为基础,吸取了NJ法和FM法中的部分理论,提出了以节点引入为手段的新的简易方法,通过该方法构建了分子系统发育树,结果表明这种方法更加快捷,而且所得结果与FM法完全一致。A new kind of distance method, named node injection (NI), is introduced to construct the phylogenetic tree. The hypothesis is based on the neighbor joining (NJ) and the Fitch - Margoliash (FM) method. Phylogenetic tree reconstructed by NI is the same as that of FM, but NJ run faster.

关 键 词:系统发育树 NJ法 FM法 节点引入法 

分 类 号:Q941[生物学—植物学]

 

参考文献:

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引证文献:

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