我国部分地区猪圆环病毒2型分离株的遗传变异分析  

Genetic variation of porcine circovirus type 2 isolates from different regions in China

作　　者：郭龙军[1] 陆月华[1] 危艳武[1] 黄立平[1] 刘长明[1] 

机构地区：[1]中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/猪传染病研究室,黑龙江哈尔滨150001

出　　处：《中国预防兽医学报》2009年第11期856-859,共4页Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine

基　　金：国家自然科学基金(30871859);国家科技支撑计划项目(2006BAD06A07);中央级公益性科研院所基本科研业务费(2008-07);兽医生物技术国家重点实验室开放基金(NKLVBP2008-07)

摘　　要：为了解我国猪圆环病毒2型(PCV2)流行毒株遗传变异情况,本研究对本实验室分离到的19株PCV2分离株通过病毒全基因组克隆和测序分析,将其分为2个大基因群和3个亚群,其基因组分别为1766nt、1767nt和1768nt,各占15.8%、73.7%和10.5%。以1767nt毒株为基准,其基因组第39或1039位有1个碱基缺失后突变成1766nt毒株;第1040位有1个碱基插入后突变成1768nt毒株。对19株病毒ORF2编码的Cap蛋白分析发现,有4株病毒编码基因发生了突变,出现了705nt和708nt两种突变型,使ORF2编码的Cap蛋白C末端分别有1和2个氨基酸增加。同时,本实验选用AccⅠ和FbaⅠ内切酶对19株病毒基因组PCR产物进行了限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析,其结果可作为流行毒株分型鉴别依据。To investigate the genetic variation of porcine circovirus type 2 （PCV2） in China, nineteen PCV2 strains isolated from the infected pigs in different regions of China were sequenced. These PCV2 isolates could be classified into two groups and three clusters with genome length of 1 766 nt （15.8 %）, 1 767 nt （73.7 %） and 1 768 nt （10.5 %）, respectively. The isolates with 1 766 nt genome had a nucleotide deletion from position 39 or 1 039, while the 1 768 nt isolates carried a nucleotide insert at position 1 040 of the genome. Four isolates had mutations at the ORF2-encoded Cap protein with additional 1 and 2 amino acid iusertion at the C terminus. Restriction fragment length polymorphism （PCR-RFLP） of nineteen isolates showed that the 1 767 nt isolates were the dominant among the PCV2 isolates. The diversity for PCV2 isolates is resulted from mutations at C terminus of Cap gene.

关 键 词：猪圆环病毒2型 流行毒株 遗传变异 限制性片段长度多态性 

分 类 号：D852.65[政治法律—政治学]