新疆和田2006年甲肝病毒流行株基因分型研究  

Genotyping of Hepatitis A virus prevalent strains in Xinjiang Hetian of China in 2006

作　　者：阿依古丽·伊尔哈力[1] 曹经瑗[2] 艾德尔·艾力[3] 文前[3] 杨世平 库热席 孟庆玲[2] 李新兰[1] 毕胜利[2] 

机构地区：[1]新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心,乌鲁木齐830011 [2]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 [3]新疆和田地区疾病预防控制中心 [4]新疆和田地区传染病医院

出　　处：《中华实验和临床病毒学杂志》2009年第5期358-360,共3页Chinese Journal of Experimental and Clinical Virology

基　　金：卫生部疾病预防控制专项（2006年）;国家自然科学基金项目（30671806）

摘　　要：目的了解2006年新疆和田甲型肝炎病毒（HAV）流行株基因型特征，为HAV溯源研究打下基础。方法收集了新疆和田部分甲肝病人血清标本，用HAV结构．非结构区基因VPI-2A引物，经核酸提取，RT-PCR，序列测定，对HAV进行基因分型研究。结果新疆和田VP1—2A区HAV核苷酸序列变异为0％-3．9％，分为不同基因簇，但都属1A亚型；VP1-2A区氨基酸序列只有0—2个差异。与已发表的2005年新疆伊犁部分甲肝病毒流行株基因有相同序列或同源性较高。结论和田有多株甲肝病毒存在，本研究流行可能有多个传染源，多个传播链，在人群免疫水平较低时，引起甲肝流行。结果表明HAV分子流行病学方法在HAV流行株遗传变异及溯源研究中，以及控制HAV流行中具有重要作用。Objective To analysis the genotypes of wild type hepatitis A virus circulated in Xinjiang Hetian of China in 2006. Methods The Vpl-2A region of HAV genome was amplified and sequenced from serum samples collected in Xinjiang Hetian of China in 2006, and subjected to phylogenetic analysis by Neighbor Joining （NJ） method. Results The nucleotide sequence differences in the VP1-2A region among Xinjiang Hetian HAV strains ranged from 0%-3.9%, all belonged to sub-genotype 1A. Genetically similar strains were identified among Xinjiang Hetian 2006 and Xinjiang Yili 2005 of China isolates. Only 0-2 amino acid differences were found among the Xinjiang Hetian HAV isolates in the VP1-2A region. Conclusion There were different HAV strains existing in the investigated areas, these strains may have different transmission pathways for the spread of the disease. The results indicate the usefulness of molecular epidemiological methods in studying changes in the circulating HAV strains and in tracing transmission routes, and also for effectively control measures to prevent the spread of the disease.

关 键 词：肝炎病毒 甲型 基因型 流行病学 分子 

分 类 号：R181.3[医药卫生—流行病学] R512.6[医药卫生—公共卫生与预防医学]