类猪圆环病毒因子P1 VP2蛋白二级结构与B细胞表位预测  

Prediction of Secondary Structure and B Cell Epitope for VP2 Protein of Porcine Circovirus-like Agent P1

作　　者：温立斌[1] 何孔旺[1] 杨汉春[2] 王玉然 

机构地区：[1]江苏省农业科学院兽医研究所,农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室,国家兽用生物制品工程技术研究中心,江苏南京210014 [2]中国农业大学动物医学院,农业部预防兽医学重点开放实验室,北京100094 [3]河北省动物卫生监督所,河北石家庄050081

出　　处：《华北农学报》2009年第5期45-49,共5页Acta Agriculturae Boreali-Sinica

基　　金：国家“973”计划前期研究专项(2007CB116308);江苏省自然科学基金(BK2008351)

摘　　要：旨为预测类猪圆环病毒因子P1 VP2蛋白的B细胞表位。采用生物信息软件和互联网服务器,预测VP2的二级结构,分析VP2表面特性(亲水性、可塑性、可及性和抗原性),综合预测VP2的B细胞抗原表位。结果表明,P1VP2蛋白肽链的6-18和80-92区段为预测的B细胞表位优势区。多参数方案综合预测P1 VP2蛋白的B细胞抗原表位,为进一步鉴定表位及设计疫苗奠定了基础。To predict the B cell epitopes for VP2 protein of porcine circovirus-like agent P1.By using biotic soft-wares and network servers,the secondary structure of VP2 was predicted,and the surface properties（hydrophilicity,flexibility,accessibility and antigenicity） of VP2 were analysed.Then the B cell epitopes integrated prediction were obtained.The predominant B cell epitopes predicted were probably in the region of 6-18 and 80-92.The results of B cell epitopes prediction using multiple parameters are helpful for further epitopes identification and vaccine design of P1.

关 键 词：P1 二级结构 B细胞表位 生物信息学 预测 

分 类 号：S852.4[农业科学—基础兽医学]