一种基于多数据源融合的酵母蛋白质相互作用预测方法  被引量:1

An Approach for Predicting Yeast Protein-Protein Interaction Network by Merging Multiple Data Sources

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作  者:杨晓飞[1] 郑浩然[1] 韩思远[1] 侯辉超[1] 张宽[1] 

机构地区:[1]中国科学技术大学计算机科学技术系,合肥230027

出  处:《北京生物医学工程》2009年第4期373-377,共5页Beijing Biomedical Engineering

基  金:国家重点基础研究发展计划(2006CB910700)资助

摘  要:蛋白质-蛋白质相互作用在生命活动中起着重要的作用。本文通过整合多个数据源,采用Logistic回归模型,对模式生物酵母所有的蛋白质之间相互作用进行了计算预测,得到了一个酵母蛋白质相互作用的加权网络,结果分析表明本文得到的蛋白质相互作用网络有较高的可靠性。Protein-protein interaction plays important roles in many cellular processes. In this paper, we combined multiple data sources, using the Logistic regression model to evaluate the possibility of interaction between every protein pair in yeast, obtaining a weighted protein-protein interaction network. The result shows that we obtain a considerably reliable protein-protein interaction network.

关 键 词:蛋白质相互作用 多数据源 LOGISTIC回归 信号通路 

分 类 号:R318.04[医药卫生—生物医学工程]

 

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