大豆短日照诱导下新ESTs序列的筛选和功能推测  

Screening and functional prediction of soybean new ESTs induced by short-days

作　　者：赵琳[1] 高阳[1] 段莹莹[1] 李永光[1] 陈李淼[1] 郝迪萩[1] 罗秋兰[1] 李文滨[1] 

机构地区：[1]大豆生物学省部共建教育部重点实验室,东北农业大学大豆研究所,黑龙江哈尔滨150030

出　　处：《中国油料作物学报》2009年第4期460-464,共5页Chinese Journal of Oil Crop Sciences

基　　金：国家自然科学基金(30671318);转基因生物新品种培育科技重大专项(2008ZX08004-005);(2009ZX08009-089B);哈尔滨市科技创新人才研究专项资金项目(RC2008QN002017);东北农业大学博士启动基金;大豆生物学省部共建教育部重点实验室开放基金项目(SB08A04);黑龙江省教育厅科学技术研究项目(11541029)

摘　　要：对大豆短日照诱导的基因表达差异进行了比较基因组分析,在细胞分子水平上从基因差异表达的角度研究短日照诱导衰老过程中基因转录物丰度的变化,探索大豆衰老的复杂机制。利用本实验室已经获得的抑制性消减杂交第二次PCR扩增产物重新构建新的cDNA文库,继续筛选差异表达的ESTs。利用BLAST软件在Gen-Bank数据库进行序列相似性比对,发现28个与暗诱导相关的差异表达新ESTs,归类并推测其参与机体暗适应上调表达的蛋白质功能,为进一步分离暗处理诱导表达的基因,揭示短日照加速衰老的作用机理提供基础数据。A comparative genome analysis was conducted on short-day induced gene expression to determine the increase of transcript abundance during senescent process in soybean plants. The second PCR amplification products of previous SSH （suppression subtractive hybridization） was used to reconstruct a new eDNA library for further ESTs screening. 28 differentially expressed functional ESTs were found and predicted by BLAST （ Basic Local Alignment Search Tool） in GenBank. The search results showed elevated gene expression in dark - induced conditions. Study on these genes in dark treatment would facilitate mechanism research on short-day accelerated senescence.

关 键 词：大豆 衰老 短日照 代谢 

分 类 号：Q945.48[生物学—植物学]