利用miRNA芯片筛选大鼠颅脑创伤后皮层差异表达的miRNA  

Difference of expression of miRNA in traumatic human cerebrum cortex by miRNA genechip

作　　者：雷平[1] 张建宁[1] 张亮[2] 赵建晴[2] 李耀华[1] 陈心[1] 杨新宇[1] 杨树源[1] 

机构地区：[1]天津医科大学总医院神经外科,损伤变异与再生重点实验室,300052 [2]生物芯片北京国家工程研究中心/博奥生物有限公司

出　　处：《中华神经外科杂志》2009年第12期1138-1141,共4页Chinese Journal of Neurosurgery

基　　金：国家973计划子课题（2005CB522604）;国家自然科学基金（30700865）;天津市“重中之重”项目（05YFGDSF02500）

摘　　要：目的筛选大鼠颅脑创伤后皮层差异表达的miRNA，为颅脑创伤治疗中的miRNA干预策略提供可供选择的目标miRNA。方法利用miRNA芯片检测伤后6h、24h、48h、72h组各2例创伤大脑皮层组织与2例正常对照的差异表达基因。并随机挑选差异表达基因做PCR验证。结果创伤后6h组共有136个miRNA表达，其中2倍以上差异表达上调的13个，2倍以上差异表达下调的14个；24h组共有118个miRNA表达，其中2倍以上差异表达上调的4个，2倍以上差异表达下调的23个；48h组共有149个miRNA表达，其中2倍以上差异表达上调的16个，2倍以上差异表达下调的11个；72h组共有203个miRNA表达，其中2倍以上差异表达上调的19个，2倍以上差异表达下调的5个。其中只有miR-21在4个伤后时间点上均高表达，分别为2．0215、2．0401、2．0702、2．7910。定量PCR验证结果提示芯片结果可信。结论创伤大脑皮层的差异表达miRNA在以往文献中鲜见报道，对其干预有望成为颅脑创伤基因治疗的新靶向。Objective This study was designed to screen the different expression of miRNA after traumatic brain injury （TBI） in rats, and to provide the target miRNA for miRNA interference in TBI treatments. Methods Differently expressd genes were examined using miRNA chip in contused cerebral tissue 6 hrs, 24 hrs, 48 hrs and 72 hrs after TBI （ 2 cases per time point）. The genes that expressed differently were chose randomly for further validation by quantitative PCR. Result 136 different expression of miRNA （13 up- regulated and 14 down- regulated more than twice） were found 6 hrs after injury, 149 （16 up- regulated and 11 down -regulated more than twice） 48 hrs after injury, and 203 （19 up- regulated and 5 down - regulated） 72 hrs after injury. Only the miR - 21 expressed higher at all the four time points （2.0215, 2. 0401,2. 0702 and 2. 7910 respectively）. Quantitative PCR approved the results as well. Conclusions The interference of differently expressed miRNA after TBI would be a new gene therapy on TBI.

关 键 词：MIRNA芯片 差异表达 颅脑创伤 

分 类 号：R686[医药卫生—骨科学]