人Izumo蛋白的二级结构及B细胞抗原表位预测  

Prediction of the secondary structure and B cell epitopes for the Izumo protein of Homo Sapiens

作　　者：杨霞[1] 刘凯军[1] 申子刚[1] 何海洋[1] 张记[1] 张巧玉[2] 吴玉章[1] 李晋涛[1] 

机构地区：[1]第三军医大学全军免疫学研究所,重庆400038 [2]解放军总医院第二附属医院妇产科,北京100091

出　　处：《中国免疫学杂志》2010年第1期37-40,共4页Chinese Journal of Immunology

基　　金：国家自然科学基金(30571708);"十一五"国家科技支撑计划(2006BAI03B12)资助

摘　　要：目的:预测人Izumo蛋白的二级结构及B细胞抗原表位。方法:以人Izumo基因序列为基础,按Chou-Fasman和Gamier-Robson方法预测其编码蛋白的二级结构,采用Karplus-Schulz方法预测Izumo蛋白骨架区的柔韧性;按Kyte-Doolittle方法预测其亲水性、Emini方法预测蛋白质表面可能性及Jameson-Wolf方法预测抗原性指数。结果:Chou-Fasman及Gamier-Robson两种方法预测的结果均表明,Izumo蛋白含较多的α螺旋,蛋白第6～17、30～40、88～99、103～120、153～160、173～188、249～260、283～297、334～338和339～346区段可能是α螺旋中心,第21～25、198～200、245～248和320～323区段可能是β折叠中心。用Kyte-Doolittle、Emini和Jameson-Wolf方法分别对Izumo蛋白B细胞抗原表位进行预测结果表明,蛋白质第36～42、62～66、94～99、118～122、129～132、151～154、161～164、173～177、205～208、212～216、256～265、271～276、283～288、314～318和336～350区段附近很可能为B细胞表位优势区域。结论:该研究结果有助于确定Izumo蛋白的B细胞优势表位及发挥免疫避孕的活性部位。Objective： To predict and analyze the secondary structure and B cell epitopes of Izumo protein. Methods： The secondary structure and flexible regions of Izumo protein were predicted by the methods of Chou-Fasman, Gamier-Robson and Karplus-Schulz. Moreover, hydrophilicity plot, surface probability plot and antigenic index of Izumo protein were predicted by the methods of Kyte-Doolittle, Emini and Jameson-Wolf, respectively. Results： Izumo protein contained more a helix regions. There were several centers of α helix in the regions of 6-17, 30-40,88-99,103-120,153-160,173-188,249-260,283-297,334-338 and 339-346 of lzumo protein, and several centers of β sheet in the regions of 21-25,198-200,245-248 and 320-323. Moreover, many distinct B cell epitopes in Izumo protein possibly localized in the regions of 36- 42,62-66,94-99,118-122,129-132,151-154, t61-164,173-177,205-208,2!2-216,256-265,271-276,283-288,314-318 and 336-350. Conclusion： These results are helpful for identification of the dominant B cell epitopes and the functional domains of Izumo protein.

关 键 词：人Izumo蛋白 二级结构 B细胞优势表位 

分 类 号：R392.11[医药卫生—免疫学]