基于微分的cDNA基因芯片图像自动划格算法  

Automatic Gridding for cDNA Microarray Images Based on Differential

作　　者：聂桂军[1,2,3] 王靖[4] 王加俊[2] 叶锡君[5] 陈强[3] 杨静宇[3] 

机构地区：[1]南京工业职业技术学院信息工程系,江苏南京210046 [2]苏州大学电子信息学院,江苏苏州215021 [3]南京理工大学计算机科学与技术学院,江苏南京210094 [4]南京人口管理干部学院信息科学系,江苏南京210042 [5]南京农业大学信息科技学院,江苏南京210095

出　　处：《江南大学学报（自然科学版）》2010年第1期16-21,共6页Joural of Jiangnan University (Natural Science Edition)　

基　　金：国家自然科学基金项目(60871086);国家863计划项目(2006AA10Z1E5);江苏省高校自然科学研究项目(09KJD510006)

摘　　要：针对cDNA基因芯片数据分析中划格对提取杂交荧光样点杂交强度信息的重要作用,提出了一种基于微分的cDNA基因芯片图像自动划格算法,采用NCBI上GEO数据库中cDNA基因芯片图像进行划格实验,验证了该算法的有效性。Image analysis is an important stage of cDNA microarray data analysis. Gridding is indispensable to accurately identify the location of each spot and extract spot intensities from the microarray images. In this paper, a differential-based automatic gridding algorithm for cDNA microarray images is presented. The experimental results on cDNA microarray images from Gene Expression Omnibus （GEO） Database of National Center for Bioteehnology Information （NCBI） demonstrate the effectiveness of this approach.

关 键 词：互补DNA 基因芯片 划格 基因表达 图像分析 

分 类 号：TP391[自动化与计算机技术—计算机应用技术]