猪T细胞受体α链基因的克隆、序列分析及其结构预测  

Cloning,Sequencing and Structure Prediction of T Cell Receptor α Genes in Pigs

作　　者：冯海燕[1] 莫斯科[1] 房永祥[1] 景志忠[1] 

机构地区：[1]中国农业科学院兰州兽医研究所,家畜疫病病原生物学国家重点实验室,农业部兽医公共卫生重点实验室,甘肃省动物寄生虫病重点实验室,甘肃兰州730046

出　　处：《华北农学报》2010年第1期23-29,共7页Acta Agriculturae Boreali-Sinica

基　　金：国家高新技术“863”项目(2006AA10A203);国家支撑计划项目(2007BAD40B03)

摘　　要：旨在为研究猪T细胞受体分子结构与功能,并首次在国内克隆了猪T细胞受体α链基因。以GenBank上登载的猪T细胞受体（Tcell receptor,TCR）α链（AB087988）为参考序列,从甘肃合作猪外周血液淋巴细胞中用RT-PCR的方法克隆了TCR-α链基因（pTCR-α）。结果表明：克隆的TCR-α基因具有完整的ORF,全长819 bp,编码272个氨基酸,预测蛋白分子量为30 kDa,含18个强碱性氨基酸,23个强酸性氨基酸,87个疏水性氨基酸和103个极性氨基酸,含有一段20个氨基酸的信号肽序列;与GenBank上登载的TCR-α参考序列（AB087988）的同源性为94.6%,与其他具有完整ORF的猪TCR-α相比,同源性为54.4%-80.3%。推测可能是一新的TCR-α基因转录本。同时,应用生物信息学技术分析了其基因序列及编码蛋白的结构特征,这为猪T细胞受体分子结构与功能的研究奠定了基础。In order to study molecular structure and function of T cell receptor,porcine T cell receptor alpha chain gene was cloned from peripheral-blood lymphocyte （PBL） of Gansu hezuo pig at the first time in domesdic. The sequence analysis shows that the ORF of total pTCR-α gene is 819 bp in length,encoding 272 amino acids with a signal peptide composed of 20 amino acids. The protein molecular weight is about 30 kDa,with 18 Strongly Basic（ ＋ ） Amino Acids,23 Strongly Acidic（ - ） Amino Acids,87 Hydrophobic Amino Acids and 102 Polar Amino Acids. The homology of nucleotide sequence of porcine TCR-α with the referenced sequence （AB087988） is up to 94.6%. Compared with other porcine genes of TCR-α published in GenBank,the homology is about 54.4% -80.3%. It may be a novel transcript of TCR-α family. In order to research molecular structure and function of T cell receptor,this study also uses bioinformaties to analyze its gene sequences and structural feature of encoding protein.

关 键 词：猪T细胞受体α链基因 基因克隆 序列分析 生物信息学 

分 类 号：Q785[生物学—分子生物学]