基于元数据的异构蛋白质-蛋白质相互作用数据库整合  

Integrating Heterogeneous Protein-Protein Interaction Databases Based on Metadata

作　　者：张智[1] 张正国[1] 

机构地区：[1]中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院,北京100005

出　　处：《中国生物医学工程学报》2010年第2期201-206,共6页Chinese Journal of Biomedical Engineering

基　　金：中华医学基金(CMB03-787)

摘　　要：研究蛋白质-蛋白质相互作用是理解生命活动的基础。在蛋白质-蛋白质相互作用的研究过程中,产生了大量来源于实验和预测的数据。这些数据存储于彼此异构的数据库中。对上述异构数据库进行数据整合是实现共享和最大限度利用已有蛋白质-蛋白质相互作用数据必须解决的关键问题。据此问题提出了基于元数据理论和查询转换方法的异构数据库整合方案,并构建了一个基于网络的蛋白质-蛋白质相互作用相关异构数据库的整合平台,成功实现了对9个蛋白质-蛋白质相互作用数据库的整合。Protein-protein interactions（PPIs） are fundamental for understanding of the biological processes of life.In the course of the study of PPIs,a large amount of data which came from experiments and predictions have been generated,and are stored in heterogeneous databases.In order to implement data sharing and maximize the use of data,it is required that these heterogeneous databases be integrated.This paper presented a solution based on the query translation technique and metadata theory to integrate heterogeneous databases.A web-based platform for integrating heterogeneous protein-protein interaction databases was built,and 9 PPI databases were integrated successfully.

关 键 词：蛋白质-蛋白质相互作用 异构数据库 数据整合 元数据 

分 类 号：R318[医药卫生—生物医学工程]