尼罗罗非鱼线粒体基因组全序列测定与系统进化分析  

Complete Mitochondrial Genome DNA of the Nile Tilapia Oreochromis niloticus and Phylogenetic Analysis

作　　者：杨丽萍[1] 卢迈新[1] 叶星[1] 朱华平[1] 高风英[1] 莫媛媛[1,2] 黄樟翰[1] 

机构地区：[1]中国水产科学研究院珠江水产研究所,广州510380 [2]广东海洋大学水产学院,湛江524088

出　　处：《中国生物化学与分子生物学报》2010年第5期484-490,共7页Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology

基　　金：国家科技支撑计划(No.2006BAD01A1201);广东省农业重点项目(No.2009B020201003);"现代农业产业技术体系建设专项资金资助"(No.nycytx-48-4);公益性行业(农业)科研专项(No.3-49);广东省海洋渔业科技推广专项(No.A200899B02);广东省重大科技兴渔项目(No.B200701A06)~~

摘　　要：参照已报道的鱼类线粒体基因序列,通过PCR扩增与测序,获得了全长为16627bp的尼罗罗非鱼线粒体基因组全序列,共编码13种蛋白质基因、2种rRNA基因、22种tRNA基因和1段控制区序列.H-链碱基组成具有明显的AT偏向性.由H-链编码的蛋白质基因在第3位密码子上相对于前2个密码子具有一定的G排斥性.L-链编码蛋白质基因在碱基组成上与H-链编码基因存在差异.编码基因除COI以GTG作为起始密码子外,其它均以ATG起始.终止密码子有2种,分别为不完全T-或TA-和TAA.L-链复制起始区位于WANCY区域(tRNATrp-tRNAAla-tRNAAsn-tRNACys-tRNATyr)的tRNAAsn和tRNACys基因间,长度为33bp.系统发育分析显示,源于非洲的口孵鱼属、蓝首鱼属和球丽鱼属聚为单系群,其中口孵鱼属莫桑比克罗非鱼先与同属罗非鱼KM-2006聚类后再与尼罗罗非鱼聚类.

关 键 词：尼罗罗非鱼 线粒体基因组 丽鱼科 系统发育 

分 类 号：Q75[生物学—分子生物学]