应用比较基因组分析检测乙型肝炎病毒中可能的重组事件  

作　　者：叶琳[1] 张原[2] 梅旖[1] 南蓬[1] 钟扬[1,3,4] 

机构地区：[1]复旦大学生命科学学院进化生物学中心,上海200433 [2]中国医学科学院病原生物学研究所,北京100730 [3]上海生物信息技术研究中心,上海200235 [4]西藏大学生物多样性与地生物学研究所,拉萨850000

出　　处：《科学通报》2010年第14期1322-1328,共7页Chinese Science Bulletin

基　　金：上海市重点学科项目(B111);上海市科委项目(07XD14025)资助

摘　　要：应用生物信息学软件RDP3和Simplot及5种重组检测算法(RDP,GENECONV,MaxChi,Chimaera和SiScan),对791个人类乙型肝炎病毒(HBV)全基因组和38个非人灵长类乙型肝炎病毒全基因组序列进行了比较分析,以检测可能的重组事件及重组子.用RDP3检测出9个重组事件及61个重组子,并用Simplot分析确定了具有两条亲代序列的6个事件中重组发生的位置.61个重组子中53个为首次发现.研究还表明PreC/C基因区域和基因边缘附近发生重组频率较高.

关 键 词：乙型肝炎病毒 重组 RDP3 Simplot 

分 类 号：R450[医药卫生—治疗学]