人类基因组CpG岛甲基化概况的预测  

作　　者：凡时财[1,2] 邹见效[1] 徐红兵[1] 张学工[2] 

机构地区：[1]电子科技大学自动化工程学院,成都610054 [2]生物信息学教育部重点实验室,信息科学与技术国家实验室生物信息学研究部,清华大学自动化系,北京100084

出　　处：《科学通报》2010年第14期1329-1334,共6页Chinese Science Bulletin

基　　金：国家自然科学基金(30625012;60721003);国家重点基础研究发展计划(2004CB518605)资助项目

摘　　要：CpG岛甲基化在细胞的各种生物过程中扮演着重要角色.开发了预测人类基因组CpG岛甲基化状态的计算模型,获得了目前最好的预测性能,并用此模型对人类全基因组的CpG岛甲基化状况进行了预测.根据预测结果,约31%的CpG岛处于甲基化状态,而位于启动子区的CpG岛则倾向于不被甲基化.染色体R带和G带中CpG岛的甲基化水平没有显著差异.基因启动子区内,不易被甲基化的CpG岛中RNA聚合酶的结合强度显著高于易被甲基化的CpG岛,表明包含不易被甲基化的CpG岛的启动子对应的基因具有更高的表达活性.

关 键 词：DNA甲基化 CPG岛 预测模型 特征选择 

分 类 号：Q78[生物学—分子生物学]