粗粒化模拟及其在生物膜研究领域的应用  

Progress of coarse-grained dynamics simulation for bilayers

作　　者：张志勇[1] 尹大川[1] 卢慧甍[1] 

机构地区：[1]西北工业大学生命科学院,空间生物实验模拟技术国防重点学科实验室,西北工业大学特殊环境生物物理学研究所,西安710072

出　　处：《生命的化学》2010年第3期438-443,共6页Chemistry of Life

基　　金：国家博士点基金(200806990011);国家自然科学基金(10772150);教育部"新世纪优秀人才支持计划"项目(NCET-06-0885);西北工业大学基础科研重点项目的资助;西北工业大学科技创新基金(2007KJ01016)资助;国家863重点项目(2008AA12A220);中国博士后科学基金(20070421131)

摘　　要：粗粒化模拟方法是近年来迅速发展的一种计算模拟方法,可实现复杂生物体系长时间和大尺度的模拟。本文介绍了该方法的模拟思想,实现途径以及在生物膜研究领域的相关应用,并对粗粒化方法未来的发展进行了展望。Coarse-grained（CG） dynamic simulation is a method for studying large scale and long time biological systems.CG method can improve computing efficiency by reducing detailed information of atomic structures and interactions.It performs well in simulating bilayer formation and interactions of membrane proteins within a lipid bilayer environment.In this paper,we introduced the process of uniformly constructing CG models of lipids and proteins,and finally proposed some applications of CG method.

关 键 词：粗粒化 计算模拟 生物膜 

分 类 号：Q73[生物学—分子生物学]