21-plex线粒体SNPs复合检测体系的建立及在广东地区汉族人群遗传多态性中的研究  被引量:1

Establishment of 21-plex mitochondrial SNPs multiple system and the study of genetic polymorphism in Guangdong Han population

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作  者:何琼[1] 刘超[2] 王双双[1] 刘长晖[2] 孙德华[3] 王慧君[1] 

机构地区:[1]南方医科大学法医学系,广东广州510515 [2]广州市刑事科学技术研究所,广东广州510030 [3]南方医科大学南方医院检验科,广东广州510515

出  处:《南京医科大学学报(自然科学版)》2010年第8期1156-1162,共7页Journal of Nanjing Medical University(Natural Sciences)

基  金:国家十一五科技支撑计划(2006BAK07B01);公安部重点科技攻关项目(20034421401)

摘  要:目的:应用SNaPshot技术建立线粒体SNPs高通量检测体系并对广东汉族人群进行遗传多态性研究。方法:从线粒体基因组中选择21个SNPs位点,自行设计引物进行复合位点扩增,其PCR产物进行纯化和复合单碱基延伸并结合毛细管电泳,实现对线粒体多个SNPs位点的高通量检测。结果:建立了21-plex线粒体SNPs复合检测体系,并调查这21个SNPs位点在广东地区汉族人群的多态性,共检测到90种单倍型,单倍型多样性为97.1%。结论:初步研究结果显示所建立的线粒体SNPs复合检测体系,在法医学实践中具有良好的应用前景。Objective:To establish high throughput mitochondrial DNA (mtDNA)SNPs detection system and study the genetic polymorphism of the Guangdong Han population by SNaPshot technology. Methods:In the present study,we selected 21 SNPs from mitochondrial genome,designed primers,performed PCR,co-amplified single base extension(SBE) and also combined with capillary electrophoresis. Results:Multiple detection system were successfully established. The genetic polymorphism of Guangdong Han population was investigated,and 90 haplotypes were detected in the studied population,and the haplotype diversity(HD) was 97.1%. Conclusion: The results show that the 21-plex mtDNA SNPs multiplex detection system has a pretty good application prospect in forensic medicine.

关 键 词:线粒体 单核苷酸多态性 复合PCR SNAPSHOT 毛细管电泳 

分 类 号:R89[医药卫生—法医学]

 

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