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作 者:熊玉芬[1] 王暄[1] 梁中伟[1] 李红梅[1]
机构地区:[1]南京农业大学植物保护学院/农业部病虫监测与治理重点开放实验室,江苏南京210095
出 处:《南京农业大学学报》2010年第4期42-48,共7页Journal of Nanjing Agricultural University
基 金:教育部留学回国基金项目[教外司留(2009)1001号];国家自然科学基金项目(30900939)
摘 要:利用RT-PCR和RACE技术克隆了一个松材线虫(Bursaphelenchus xylophilus)乙酰胆碱酯酶基因Bx-ace-2,该基因cDNA全长为2010bp,有1878bp的开放阅读框(ORF),推测其编码的蛋白有625个氨基酸;Bx-ace-2基因组克隆长为2192bp,含有7个内含子。氨基酸序列比对和同源性分析显示:松材线虫Bx-ace-2编码的乙酰胆碱酯酶与已报道的秀丽小杆线虫ACE-1、ACE-3和ACE-4型乙酰胆碱酯酶的相似性为28%~31%,而与秀丽小杆线虫ACE-2及甘薯茎线虫、南方根结线虫、大豆胞囊线虫、马铃薯白线虫和胎生网尾线虫的ACE-2型乙酰胆碱酯酶的氨基酸序列相似性为44%~52%。构建的系统进化树也显示:松材线虫乙酰胆碱酯酶与其他线虫的ACE-2型乙酰胆碱酯酶具有相对更近的遗传距离,因此推测该松材线虫乙酰胆碱酯酶也属于ACE-2型。A new gene,Bx-ace-2,encoding an acetylcholinesterase (AChE),was cloned from Bursaphelenchus xylophilus by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and rapid amplification of cDNA ends (RACE).The full length cDNA is 2 010 bp with an open reading frame (ORF) of 1 878 bp which was deduced encoding a protein with 625 amino acids.The length of genomic clone of the gene Bx-ace-2 is 2 192 bp which contained seven introns.The deduced protein sequence encoded by Bx-ace-2 from B.xylophilus shares 28%-31% similarities with those of ACE-1,ACE-3 and ACE-4 from Caenorhabditis elegans.However,it shares 44%-52% similarities with ACE-2 from C.elegans,Ditylenchus destructor,Meloidogyne incognita,Heterodera glycines,Globodera pallida and Dictyocaulus viviparus.The phylogenetic analysis of AChEs demonstrated that the protein encoded by Bx-ace-2 was clustered into a same group with ACE-2 type of acetylcholinesterases from the aforementioned nematodes.Therefore,it was deduced that the protein encoded by Bx-ace-2 belonged to ACE-2 type of acetylcholinesterase.
关 键 词:松材线虫 乙酰胆碱酯酶基因 CDNA克隆 RACE
分 类 号:Q754[生物学—分子生物学] S432.1[农业科学—植物病理学]
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