正交设计优化广藿香基因组SRAP扩增体系的研究  

作　　者：吴友根[1,2] 郭巧生[1] 何际婵[2] 林尤奋[3] 

机构地区：[1]南京农业大学中药材研究所,江苏南京210095 [2]中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,海南儋州571737 [3]热带园艺植物资源与遗传改良教育部重点实验室/海南大学园艺园林学院,海南海口570228

出　　处：《江苏农业科学》2010年第4期18-21,共4页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：国家自然科学基金(编号:30960533);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(编号:PZS053);海南省自然科学基金(编号:310022);海南省教育厅高等学校科学研究项目(编号:Hjkj2009-25);海南大学科研项目(编号:hd09xm58);海南大学科研启动基金(编号:kyqd1002)

摘　　要：以改良CTAB法提取的广藿香叶片DNA为模板,采用正交试验设计,从Mg2+、dNTP、引物浓度和DNA聚合酶4因素3水平,对SRAP扩增效果进行研究,比较不同模板DNA浓度对PCR扩增的影响,确立适合广藿香SRAP-PCR反应的最佳体系。利用SRAP-PCR优化体系对引物进行了全面筛选。结果表明:各因素不同水平浓度对PCR反应结果均有显著影响,总体积20μL的SRAP-PCR优化反应体系中含有:2μL 10×buffer、20 ng模板DNA、1.5 mmol/L Mg2+、250μmol/L dNTP、0.3μmol/L Primer、TaqDNA聚合酶1.5 U。运用该体系对部分广藿香单株进行检验,证明该体系稳定可靠;以此体系为基础从90对引物中共筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SRAP引物18对。

关 键 词：广藿香 SRAP标记 正交试验 体系优化 

分 类 号：S567.239.01[农业科学—中草药栽培]