肠道病毒C组山东地方株的基因型分布  

Genotype Distribution of Enterovirus Group C in Shandong Province,China

作　　者：李岩[1] 刘尧[1] 王海岩[1] 陶泽新[1] 宋立志[1] 刘桂芳[1] 冯蕾[1] 冯艺[1] 林小娟[1] 杨赫[2] 樊庆莹[2] 徐爱强[1,2] 

机构地区：[1]山东省疾病预防控制中心山东省传染病预防控制重点实验室,济南250014 [2]山东大学公共卫生学院,济南250012

出　　处：《病毒学报》2010年第5期363-367,共5页Chinese Journal of Virology

基　　金：国家科技重大专项<病毒性传染病病原谱流行规律及变异研究>课题(2009ZX10004-202);山东省医药卫生重点项目计划课题(2007HZ090)

摘　　要：C组肠道病毒（Human enterovirus C,HEV-C）共包括18个血清型,通过使用现有的组合血清进行中和试验的方法难以鉴定它们的型别。为探讨HEV-C山东地方株的基因型分布及分子进化特征,本研究对1994年~2008年急性弛缓性麻痹（Acute flaccid paralysis,AFP）监测系统中分离到的未定型的毒株,采用HEV-C VP1完整编码区的特异性引物,进行逆转录-聚合酶链反应（Reverse transcriptase-polymerase chain reaction,RT-PCR）,产物进行序列测定后,通过NCBI服务器中BLAST程序进行型别鉴定,并与其他HEV-C各基因型代表株进行比较并构建系统发生树。共获得12株HEV-C山东地方株,分别属于4个基因型：CA20、CA21,CA24和EV96。各基因型内山东地方分离株跟原型株相比基因序列同源性较低,系统发生学分析显示HEV-C山东地方株各血清型与原型株亲缘关系较远,提示山东省存在不同基因特征的HEV-C传播。Human Enterovirus C group（HEV-C） includes 17 serotypes,which can not be serotype-identified by neutralization test using antiserum pool for NPEV.In order to elucidate the genotypes and molecular evolution of HEV-C in Shandong Province,We selected the strains isolated from AFP cases between 1994-2009 to perform reverse transcriptase-polymerase chain reactions（RT-PCR） by the primers specific for entire VP1 coding gene of HEV-C and sequencing.The phylogenetic tree was then constructed among these VP1 nucleotide sequences and other prototype strains.Totally 12 Shandong local strains were obtained and separated into 4 genotypes,CVA20,CVA21,CVA24 and EV 96.The homologous comparison and phylogenetic analysis showed Shandong strains were distinct from prototype strains in each genotype.This report showed that different genotype HEV-C strains spread widely in Shandong Province.

关 键 词：肠道病毒 急性弛缓性麻痹 分子流行病学分析 

分 类 号：R373.2[医药卫生—病原生物学]