牛LAP3基因内含子12和外显子13单核苷酸多态性  

Single Nucleotide Polymorphisms(SNPs) within intron 12 and exon 13 of LAP3 gene in Bos taurus

作　　者：郑雪[1,2] 鞠志花[2] 李荣岭[2] 李秋玲[2] 张爱武[1] 仲跻峰[2] 王长法[2] 

机构地区：[1]吉林农业大学中药材学院,长春130118 [2]山东省农业科学院奶牛研究中心,济南250100

出　　处：《中国农业科技导报》2010年第5期74-79,共6页Journal of Agricultural Science and Technology

基　　金：国家863计划项目(2007AA10Z169);山东省良种工程项目(2007LZ10-06);山东省攻关项目(2009GG20002033);山东省农业科学院高技术自主创新基金项目(2007YCX019)资助

摘　　要：采用单链构象多态性(single-strand conformation polymorphism,SSCP)、创造酶切位点PCR(createdrestriction site-PCR,CRS-PCR)、限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)以及直接测序方法,研究中国荷斯坦牛、鲁西黄牛和渤海黑牛LAP3基因第12内含子和第13外显子的单核苷酸多态性(SNP)。共检测到5个SNP,分别为24 794(T/G)、24 803(T/C)、24 846(T/C)、24 564(G/A)和25 415(T/C),其中24 564(G/A)为首次报道的位点。经PCR-SSCP结合测序图谱发现24 794(T/G)、24 803(T/C)、24 846(T/C)位点完全连锁,但该连锁位点在鲁西黄牛群体中未检测到。5个SNP位点在中国荷斯坦牛、鲁西黄牛和渤海黑牛群体的优势等位基因相同,分别是T、T、T、G、T,其等位基因频率分别是T(CH0.579/LY 1/BB 0.722)、T(CH0.579/LY1/BB 0.722)、T(CH0.579/LY1/BB 0.722)、G(CH0.584/LY0.775/BB 0.500)和T(CH0.596/LY 0.796/BB 0.750),多态信息含量均在0.25至0.5之间,属于中度多态。SNPs of the intron 12 and exon 13 of LAP3 were analyzed by PCR-SSCP,CRS-PCR,PCR-RFLP and sequencing in Chinese Holstein cattles（CH）,Luxi Yellow cattles（LY） and Bohai Black cattles（BB）.Five SNPs of 24 794（T/G）,24 803（T/C）,24 846（T/C）,24 564（G/A）and 25 415（T/C） were detected.Among them SNP 24 564（G/A） was new.Three SNPs of 24 794（T/G）,24 803（T/C）,24 846（T/C）were linked completely and detected by PCR-SSCP,but they were not found in Luxi Yellow cattles.The alleles T,T,T,G and T were the dominant alleles in 3 breeds,and the allelic frequencies are T（CH0.579/LY 1/BB 0.722）,T（CH 0.579/LY 1/BB 0.722）,T（CH 0.579/LY 1/BB 0.722）,G（CH 0.584/ LY 0.775/BB 0.500） and T（CH 0.596/LY 0.796/BB 0.750）.The PIC of the 5 SNPs in these 3 breeds all belong to the midrange polymorphism（0.25PIC0.5）.

关 键 词：牛 LAP3基因 单核苷酸多态性 单链构象多态性 优势等位基因 

分 类 号：Q31[生物学—遗传学]