关联分析定位水稻第4号染色体的芒性基因并结合连锁分析精细定位Awn4.1  

作　　者：胡广隆[1] 张冬玲[1] 潘慧乔[1] 李本[1] 吴建涛[1] 周雪崖[2] 张群远[1,3] 周雷[1] 姚国新[1] 李俊周[1] 李金杰[1] 张洪亮[1] 李自超[1] 

机构地区：[1]中国农业大学农业部作物基因组学与遗传改良重点实验室,北京市作物遗传改良重点实验室,北京100193 [2]生物信息学教育部重点实验室,信息国家实验室生物信息学研究部,清华大学自动化系,北京100084 [3]Division of Statistical Genomics,Washington University School of Medicine

出　　处：《科学通报》2010年第27期2777-2781,共5页Chinese Science Bulletin

基　　金：国家重点基础研究发展计划(2010CB125904;2004CB117201);国家高技术研究发展计划(2006AA10Z158)资助项目

摘　　要：芒性是水稻一个重要的驯化相关性状,但目前还没有其精细定位及关联分析的报道.利用303份栽培稻微核心种质材料和一个200株的BC5F2分离群体,考察其芒性表现和基因型,通过关联分析和连锁分析相结合的方法定位水稻第四号染色体的芒性基因.首先,运用logistic回归进行标记与性状的初步关联分析,在第4号染色体上发现了5个关联位点,包括了前人所发现的所有位点.然后,在其中一个位点Awn4.1的区间内加密标记,通过连锁分析与关联分析相结合的策略将芒基因Awn4.1精细定位在330kb的区间内,为克隆芒基因Awn4.1打下基础.结果表明,利用核心种质材料,结合连锁分析与关联分析方法能够更加高效和准确地定位水稻基因.

关 键 词：水稻 芒 关联分析 连锁分析 基因定位 

分 类 号：S511[农业科学—作物学]