生物信息方法分析灰霉菌衰退相关病毒蛋白的功能  

The Function Analysis of Protein Coded by Botrytis Cinerea Debilitation-related Virus(BcDRV) by Using Methods of Bioinformatics

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作  者:王巍杰[1] 郭成志[2] 

机构地区:[1]河北理工大学化工与生物技术学院,河北唐山063009 [2]河北理工大学轻工学院,河北唐山063020

出  处:《河北理工大学学报(自然科学版)》2010年第3期121-123,共3页Journal of Hebei Polytechnic University:Social Science Edition

摘  要:利用Blast在GenBank数据库对BcDRV病毒相关基因进行简单定位和同源性检索分析,并对BcDRV病毒编码蛋白的结构进行分析和预测,同时在蛋白数据库中检索该蛋白所属家族蛋白线粒体病毒的RNA聚合酶信息,利用所得的结果以多序列比对的方式确立蛋白家族的进化关系,建立进化树,并使用Interpro数据库详细的分析蛋白功能。The basic homology information of Botrytis cinerea debilitation-related Virus(BcDRV) is obtained by Blast search against GenBank database,using bioinformatics techniques predicts and analyzes the structure of BcDRV coding protein.Also the possible protein family information is got by biological database searching,which is used to determine the revolutionary relationships among the BcDRV coding protein and the numbers of protein family.

关 键 词:生物信 同源 进化树 保守位点 

分 类 号:Q939.4[生物学—微生物学]

 

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