茶树实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择  被引量:101

Reference Genes for Real-time Fluorescence Quantitative PCR in Camellia sinensis

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作  者:孙美莲[1] 王云生[2] 杨冬青[1] 韦朝领[1] 高丽萍[2] 夏涛[1] 单育[1] 骆洋[2] 

机构地区:[1]安徽农业大学农业部茶叶生物化学与生物技术重点实验室,合肥230036 [2]安徽农业大学生命科学学院,合肥230036

出  处:《植物学报》2010年第5期579-587,共9页Chinese Bulletin of Botany

基  金:973计划前期项目(No.2007CB116211);国家自然科学基金(No.30771755和No.30972401);安徽省自然科学基金(No.09041-1006)

摘  要:选择合适的内参基因是提高实时荧光定量PCR分析(qRT-PCR)准确性的先决条件。该文以茶树(Camellia sinensis)芽、叶、幼根、嫩茎、花瓣、种子和愈伤组织为材料,应用实时荧光定量PCR技术,分析了18S rRNA、GAPDH、β-actin和α-tubulin4个常用内参基因在茶树不同器官组织中的表达情况。经GeNorm和NormFinder软件分析发现,当利用荧光定量PCR分析比较茶树不同器官组织中的基因表达差异时,可选择β-actin作为校正内参基因;而比较不同成熟度的叶片和愈伤组织时,可以选择GAPDH作为校正内参基因。The selection of a suitable reference gene is an important prerequisite for successful gene expression analysis by real-time fluorescence quantitative PCR (qPCR).We investigated the expression stability of 4 endogenous candidate genes (18S rRNA,GAPDH,β-actin and α-tubulin) in qPCR experiments in different organs and tissues,including buds,leaves,young roots,stem,petals,seeds,and callus,of the tea plant Camellia sinensis (L.) O.Kuntze.The analysis with GeNorm and NormFinder algorithms revealed that β-actin could be used as a reference gene for organs and tissues and GAPDH for mature leaves and callus.

关 键 词:茶树 实时荧光定量PCR 内参基因 

分 类 号:Q943.2[生物学—植物学]

 

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