元胞自动机在蛋白质折叠中的应用  

Application of Cellular Automata in Protein Folding

作　　者：武瑞婵[1] 胡道春 

机构地区：[1]襄樊学院数学与计算机科学学院,湖北襄樊441053 [2]湖北新洋丰肥业股份有限公司,湖北荆门448000

出　　处：《武汉理工大学学报》2010年第20期65-68,共4页Journal of Wuhan University of Technology

基　　金：国家自然科学基金(70371063)

摘　　要：蛋白质折叠过程是热力学过程和动力学过程的综合,要对折叠过程进行研究,寻找能量函数的极小值,需借助简化模型和特殊方法进行。首先利用二维元胞自动机模拟了雪花的生长,然后利用其能很好地体现生命演化的并行性、演化性及自组织性等特点来研究蛋白质折叠,提出了并行HP格子模型。这种模型不仅便于对生命现象进行更真实的模拟,而且弥补了传统模型均为串行模型的不足。Folding course of protein includes a course of thermodynamics and that of dynamics;so,simple model and feasible method are all necessary in course of the research of protein folding.This paper gives the simulation of snow-growth by cellular automaton,and then researches the protein folding using the idea of parallel evolvement of cellular automata.A new model——parallel HP lattice model is presented at the same time.This model can simulate vital phenomena even really, and can remedy some shortages of serial lattice HP model.

关 键 词：元胞自动机 蛋白质折叠 并行HP格子模型 

分 类 号：TP301.6[自动化与计算机技术—计算机系统结构]