常州地区2009年5~10月肠道病毒71型遗传进化初步分析  被引量:2

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作  者:石旦[1] 李坤[1] 史伟峰[1] 罗光华[2] 徐晓怡[3] 丁翠君[4] 

机构地区:[1]苏州大学附属第三医院检验科,江苏常州213003 [2]苏州大学附属第三医院综合实验室,江苏常州213003 [3]常州市疾病预防控制中心,江苏常州213000 [4]常州市儿童医院,江苏常州213003

出  处:《临床检验杂志》2010年第6期473-474,共2页Chinese Journal of Clinical Laboratory Science

基  金:常州市卫生局重大课题(ZD200912)

摘  要:目的调查常州地区2009年5~10月肠道病毒71型(EV71)种系进化。方法采集患者咽拭子标本,用荧光定量PCR法扩增VP1区序列,基因测序并构建系统发生树。结果 41份咽拭子标本阳性27株(65.9%),挑选5份阳性标本进行PCR克隆测序,CZ02、CZ03、CZ05、CZ06、CZ07 5株病毒与A、B基因型代表株差异较大,核苷酸同源性为86.3%~87.8%;与C1、C2、C3亚型的同源性为90.8%~93.8%,与属于C4亚型的中国大陆深圳株、贵州株、浙江株、重庆株和阜阳株同源性为95.4%~97.7%。结论常州地区2009年5~10月份EV71病毒已测序的5株可定为C4亚型。

关 键 词:肠道病毒71型 手足口病 PCR-荧光探针法 进化分析 

分 类 号:R373.2[医药卫生—病原生物学]

 

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