香港海鸥形菌DNA脉冲场凝胶电泳的技术条件  

Analysis of Laribacter hongkongensis DNA Using Pulsed-field Gel Electrophoresis

作　　者：冯嘉丽[1] 胡静[1] 陈清[1] 

机构地区：[1]南方医科大学公共卫生与热带医学学院流行病学系,广州510515

出　　处：《热带医学杂志》2010年第10期1187-1189,共3页Journal of Tropical Medicine

基　　金：国家自然科学基金(No.30700686);广东省医学科研基金(No.A2006367);病原微生物生物安全国家重点实验室开放课题(No.SKLPBS0905)

摘　　要：目的 探索香港海鸥形菌(Laribacter hongkongensis,LH)DNA脉冲场凝胶电泳技术的条件。方法 从2株LH参考株中提取DNA,经过限制性内切酶SpeI的切割,再用脉冲场凝胶电泳仪进行DNA分子分型,比较5种条件的分型效果。结果 在OD值为1.8、细胞裂解4 h、SpeI 20U酶切20 h、电泳脉冲时间为2.2～54.2 s、电泳25 h的条件下,LH基因组DNA片段得到良好分离。结论 上述条件产生的LH DNA指纹图谱图像清晰,分辨率高,在没有图像分析仪的情况下,肉眼即可进行判断。证实所建方法可行,条件适合。Objective To optimize the conditions of pulsed-field gel electrophoresis for the analysis of Laribacter hongkongensis DNA.Methods Genomic DNA of two L.hongkongensis strains was extracted,cut by restriction enzyme SpeI and analyzed using CHEF-Mapper（Bio-Rad）.Five profiles of different conditions were compared.Results The whole genomic DNA of L.hongkongensis was well resolved in the gel under the condition of OD 1.8,cell splitting in 4 h,SpeI（20U） digestion for 20 h,and electrophoresis with an initial switch at 2.2 s and a final switch at 54.2 s running for 25h.Conclusion A high resolution profile was obtained under these conditions.

关 键 词：香港海鸥形菌 脉冲场凝胶电泳 条件 

分 类 号：R378.2[医药卫生—病原生物学]