HCV感染者第一高变区及部分膜区序列变异的分子进化分析  

Construction of the evolutionary tree of envelope sequences of HCV from infected blood donors

作　　者：张向颖[1,2] 修冰水[2] 张贺秋[2] 祁自柏[1] 安媛[3] 邱艳[3] 

机构地区：[1]中国药品生物制品检定所,北京100050 [2]军事医学科学院基础医学研究所 [3]北京红十字血液中心

出　　处：《中国输血杂志》2010年第11期926-928,共3页Chinese Journal of Blood Transfusion

基　　金：国家863目标导向课题(2008AA02Z434);"十一五"国家科技重大专项(2008ZX10002-013);"重大新药创制"科技重大专项项目(2009ZX09103-621);北京市自然科学基金(7082048)

摘　　要：目的比较分析HCV第一高变区及包含第一高变区(HVR1)在内的部分膜区序列变异,从分子进化角度探讨献血者体内HCV变异。方法通过RT-PCR钓取5名HCV感染献血者体内含HVR1的部分膜区序列,选取10个克隆进行序列测定,并采用ClustalX软件,对获得的50条HVR1区和50条膜区序列进行了横断面的分子进化树分析。结果部分HCV感染者体内自身10条HVR1序列之间的亲缘关系较远;但感染者体内10条膜区序列之间亲缘关系较近,并呈现出一定的个体特异性。结论相比单纯分析HVR1区的变异情况,以含HVR1的膜区序列进行的进化分析更能体现出个体的差异,对于HCV的溯源更有意义。Objective To analyze the variations of HVR1 and envelope sequences of HCV from infected blood donors.Methods RT-PCR and ClustalX were used to construct the evolutionary tree on HVR1 gene fragments in 5 carriers.Results The phylogenetic tree of 50 HVR1 sequences displayed cross-donor evolution,but the phylogenetic tree of envelope sequences including HVR1 gene,displayed individual specificity in different blood donors infected with HCV.Conclusion The phylogenetic tree of envelope sequences will be helpful in trailing the transmission pathway of hepatitis C at molecular level.

关 键 词：丙型肝炎病毒 第一高变区 变异 分子进化 输血 

分 类 号：R512.63[医药卫生—内科学] R457.1[医药卫生—临床医学]