两种肠道腺病毒基因型分型标本处理方法的比较  被引量:1

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作  者:阳莉[1] 卢建溪[1] 王强[1] 黄建华[2] 周才[3] 

机构地区:[1]中山大学疫苗研究所,广州510630 [2]中山大学附属第三医院检验科 [3]广东省妇幼保健院检验科

出  处:《中华临床医师杂志(电子版)》2010年第10期156-158,共3页Chinese Journal of Clinicians(Electronic Edition)

基  金:国家高技术研究发展计划(863计划)(2007AA021002);广东省自然科学基金资助项目(7001521);广东省科技计划资助项目(2008B030301101)

摘  要:目的通过对两种肠道腺病毒基因型分型方法进行比较,以寻找出简便快速的肠道腺病毒基因型分型方法。方法采集114例非腹泻人群的粪便样本,方法一:在A549细胞中进行培养,提取病变细胞的DNA进行PCR扩增,然后克隆、测序,确定病毒基因型;方法二:直接提取粪便悬液过滤上清DNA进行巢式PCR扩增,对PCR阳性者进行克隆、测序以及基因型分型。结果 114份样本中,两种方法均有12份样本检出腺病毒,阳性率为10.5%(12/114)。序列分析显示,两种方法检出的腺病毒型别一致。这12份样本分别属于人腺病毒5型(3份)、7型(2份)、12型(3份)及48型(4份)。结论虽然两种方法的敏感性、特异性一样,但方法二是直接提取粪便悬液过滤上清基因组DNA进行巢式PCR扩增,而无需如方法一中所进行的3次体外病毒分离实验,节省了实验的时间及成本,因此值得推荐。

关 键 词:腺病毒科 基因型 序列分析 

分 类 号:R440[医药卫生—诊断学]

 

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